協會是寧夏回族自治區經濟委員會批準設立，經寧夏回族自治區民政廳依法登記的社會團體法人組織。協會接受寧夏回族自治區經濟委員會和寧夏回族自治區民政廳的管理和監督。同時，接受寧夏回族自治區食品藥品監督管理局的指導與監督。協會的前身是寧夏醫藥商業協會。為了適應寧夏地區醫藥事業快速發展的需要，經自治區政府部門批準，于2007年7月30日正式更名為“寧夏醫藥行業協會”。協會是依照國家有關法律、法規自愿組成的非盈利性的全區醫藥行業社會團體法人組織，是企業與政府的中介機構，是自主性、自律性的醫藥行業管理組織。協會的宗旨是服務。協會遵守國家憲法、法律、法規，遵守社會道德風尚。堅持“以人為本，面向行業，多做實事”的原則，正確貫徹政府意圖，反映會員單位的合理要求，維護公平競爭，為促進寧夏地區醫藥生產經營的健康發展提供服務。