醫(yī)院成立于1949年10月，經過近70年為百姓服務的征程，是一所集醫(yī)療、教學、科研、康復、急救、健康維護、司法鑒定于一體的國家三級甲等綜合性醫(yī)院。現為國家三級甲等綜合性醫(yī)院，安徽醫(yī)科大學附屬亳州醫(yī)院，安徽理工大學附屬亳州醫(yī)院，安慶醫(yī)藥高等專科學校雙主體教學合作醫(yī)院，全國百姓放心百佳示范醫(yī)院，國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地。醫(yī)院現有4個院區(qū)。本部位于高新區(qū)，總占地面積360畝，總建筑面積28萬平方米；北院區(qū)位于老城區(qū)中心，功能定位主要為醫(yī)養(yǎng)結合中心、康復中心和健康管理中心；另有市華佗國醫(yī)館分院和薛閣社區(qū)分院。醫(yī)院編制床位2000張，設置臨床醫(yī)技科室69個。