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圖書館的前身是始建于1956年的原新疆醫學院圖書館。2006年擴建館舍面積為1.68萬平方米，2020年主體搬遷至雪蓮山校區，同時保留新醫路校區圖書館功能，新館館舍面積4.8萬平方米。圖書館館藏資源豐富，圖書館紙本資源總量為170余萬冊；訂購中外文數據庫46個、訂購中外文電子圖書70.42萬種、中外文電子期刊61.58萬冊（中文電子期刊57.96萬冊，外文電子期刊3.62萬冊）；NSTL授權使用的回溯數據庫50個，包括Springer回溯數據庫、Nature回溯數據庫、OUP（牛津大學出版社）回溯數據庫等1122種期刊、300多萬篇外文文獻。電子資源的內容主要涵蓋醫學、藥學、生物、教育、社會科學等領域。
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