巴南區的前身是千年歷史名邑巴縣。早在3000多年前的商代，巴人就在此繁衍生息，立國建都。秦代置巴郡，南朝齊代置墊江縣，北周時改稱巴縣并沿襲至1995年。1995年經國務院批準撤縣建區，成立巴南區。歷史上，巴縣先后涌現出了“寧拋頭顱不丟寸土”的英雄將軍巴蔓子、“革命軍中馬前卒”鄒容、辛亥革命志士楊滄白、新中國首任女大使丁雪松等優秀兒女。區境內常住人口以漢族為主，其次有苗族、回族、藏族、彝族等40多個少數民族2500余人。
巴南區位于重慶市主城區南部，屬重慶都市經濟發達圈。全區幅員面積1827平方公里，轄花溪鎮、南泉鎮、界石鎮、南彭鎮、惠民鎮、木洞鎮、雙河口鎮、麻柳嘴鎮、豐盛鎮、二圣鎮、東泉鎮、姜家鎮、天星寺鎮、接龍鎮、石灘鎮、石龍鎮、一品鎮、跳石鎮、安瀾鎮19個鎮和魚洞、李家沱兩個街道辦事處。截止2006年底，全區有206個村、77個社區居委會。東與重慶市涪陵區、南川區接壤，南與綦江縣、江津區毗鄰，西與九龍坡區、大渡口區隔江相望，北與南岸區相接。區政府駐地魚洞，距市政府駐地21公里，距重慶火車站22公里，距重慶港口23公里，距重慶機場45公里。
巴南區區位優勢明顯。距重慶市中心7公里，區政府距市政府駐地21公里。長江橫貫區境，李家沱和馬桑溪兩座長江大橋溝通南北，重慶“二環八射”中有“二環二射”（內環、繞城，渝黔、渝湘）貫穿區境，其中，渝黔、渝湘兩大出海通道與內環、繞城快速通道在境內交匯；正在建設的渝利鐵路巴南段，規劃中的渝黔鐵路復線綦江段經一品、界石支線，以及全市規劃的9條輕軌線中有3條線（2號線、3號線、8號線）進入境內
巴南區地形以丘陵為主，低山次之，平地極少。土壤類型有水稻土、紫色土、熒壤土、潮土等。屬亞熱帶溫潤氣候，四季分明，春早秋遲，夏熱冬暖，初夏有梅雨，盛夏多伏旱，秋季有綿雨，冬季多云霧，霜雪甚少，無霜期長，日照少，風力小，濕度大。境內河流屬長江水系，有流經境內的五布河、花溪河、一品河等大小河流10余條，流域面積1702.24平方公里，占區幅員面積的93.30%。區內有各種水利設施5075處，總蓄水量12040萬立方米，常年灌溉面積33.42萬畝，有效灌溉面積25.87萬畝，農業豐收有較可靠的保證。
巴南區自然資源豐富，開發潛能大。全區有植物資源近4000種，農作物品種繁多，除栽植糧、油、蔬菜和大量經濟作物品種外，經濟果木有柚、柑橘、梨、棗、桃、李、杏、板栗和茶、桑、桐等。區境內有動物資源數百種，有礦資源數十種。曾先后開發利用的有原煤、鐵礦、石油、天然氣、頁巖、石灰石、白云石、石英砂、鉀土、砂金、地熱水等。石灰石、白云石、石英砂和鉀土、砂金等資源的開采，成為農民致富的門路之一。全區現有多家頁巖磚廠，對頁巖的開發利用數量較大；地熱水的出水點較多，已在東泉、南泉、橋口壩等地多處開發利用。
巴南區山川秀美，旅游資源豐富。全區的森林覆蓋率超過25%，山、水、林、泉、洞、湖、溪、河、瀑、谷等自然資源和抗戰文化遺址、民俗文化等人文旅游資源遍布區內，形成了“三泉”（南泉、東泉、橋口壩溫泉）、“三山”（圣燈山、樵坪山、云篆山）、“兩島”（木洞桃花島、魚洞中壩島）、“一湖”（南湖）、“一洞”（姜家溶洞）、“一場”（重慶國際高爾夫球場）、“一區”（安瀾鷺類自然保護區）的景區格局。尤其是素有“天然桑拿浴”美譽的東溫泉熱洞更是亞洲一絕；“川東小峨眉”圣燈山被譽為“植物基因寶庫”；樵坪山、云篆山古戰場遺跡依稀可辨。2001年被評為中國“優秀旅游城區”。
【歷史沿革】 巴南區由巴縣改設而成，從古至今名凡五易。在劉宋以前曰江洲，齊、梁、西魏曰墊江，自宇文周曰巴縣，民國元年（1912年）易名重慶府，民國2年恢復巴縣。1995年始為今稱。
西周至戰國，轄境屬巴國地。周慎靚王五年（公元前316年）秦滅巴國，周赧王元年（公元前314年）秦在巴國舊域設縣治理，江州縣為其一，隸于巴郡。南齊永明五年（公元487年），改江州縣為墊江縣，北周武成三年（561年）又改墊江縣為巴縣，并廢枳縣入于巴縣。
巴縣新置時屬楚州巴郡，隋代屬渝州、巴郡，唐代屬渝州、南平郡、渝州，宋代屬渝州、恭州、重慶府。元代屬重慶路，明清時期屬重慶府；辛亥革命后由重慶蜀軍政府直轄，民國2年屬川東道（后改為東川道），民國17年屬四川�。唤夥懦鯇俅�東區巴縣專區，旋屬璧山專區，1951年1月改屬重慶市，1953年2月劃屬四川省江津專區，1958年11月回屬重慶市。1994年12月，撤縣設區，為重慶市轄近郊城市區。
自周赧王元年（公元前314年）起至民國28年（1939年）間，均設縣治于今重慶市渝中區解放東路，歷與郡、州、路、府同城而治，并為附廓大縣。此后治地多遷。民國28年，按國民政府令，縣政府遷至市外辦公，暫住人和鄉（今九龍坡區華巖鎮），民國30年遷駐新治李家沱馬王坪。解放后由于市縣界變動，于1952年10月暫遷南溫泉，1954年1月遷駐魚洞鎮。改縣設區后治地仍舊。
由縣而區，古今沿革，轄境多易：
巴縣新置時，幅員遼闊，轄今之渝中區、江北區、沙坪壩區、九龍坡區、大渡口區、巴南區、南岸區、渝北區、北碚區大部、璧山縣、長壽縣和涪陵市枳城區、李渡區、南川市、武隆縣所屬區域。
北周保定四年（564年），劃出今涪陵市枳城區、李渡區、武隆縣所屬區域，置涪陵鎮。
唐武德元年（618年）、武德三年（620年）、貞觀四年（630年）、貞觀十一年（637年）、至德二年（757年），劃出今長壽縣、南川市所屬區域及中梁山以西大部分地區，先后分置永安、樂溫、溫山、南平、隆化、璧山諸縣。
元至元二十二年（1285年）廢壁山，其地并入。
明成化十九年（1483年），劃出縉云山以西境域，復置璧山縣。清乾隆二十四年（1759年），劃出今江北區、渝北區所屬區域及北碚區所轄嘉陵江以北地區，置江北廳，又劃出祥里部分地區（宋代依來鄉）隸璧山縣。
民國18年（1929年）重慶建市，自民國21年市縣劃界起至1960年的28年間，迭經市縣界變動和鄰縣縣界調整，先后劃出縣境中梁山與長江、嘉陵江之間除今跳蹬鎮以外的地區（含當時的重慶城區）、今歇馬鎮及其以北的地區、今南泉鎮及沿銅鑼山至峽口鎮的沿江地區、高歇和馬鬃兩鄉所屬區域。其間于1953年，原屬北碚市的關口鄉劃入巴縣。
至1994年，縣境東西寬73公里，南北長70公里，幅員面積2551.26平方公里，仍三面環繞重慶市區。
1994年12月，改巴縣為重慶市巴南區，并在1995年2-3月間相應進行轄區調整，劃出原巴縣所轄長江以北的全部境域和長江以南的長生橋、迎龍、廣陽3鎮所屬區域，劃入九龍坡區所屬長江南岸的地區（除二塘村劃歸南岸區外），遂成今之巴南區域。