巴丹吉林鎮，即內蒙古自治區阿拉善右旗政府所在地，阿拉善右旗政治、經濟、文化和社會活動中心。原名額肯呼都格鎮，幾年來，隨著改革開放和社會經濟的日益發展，巴丹吉林鎮已成為集工業、農業、交通、服務業為一體的新型城鎮。
2011年5月24日，根據內政字[2011]143號《內蒙古自治區人民政府關于阿拉善右旗額肯呼都格鎮更名為巴丹吉林鎮的批復》，阿盟阿右旗旗府所在地額肯呼都格鎮被批復更名為巴丹吉林鎮。
廢止的舊地名“額肯呼都格”系蒙古語，意為“上井子”或“第一個井”。1961年5月25日，阿右旗正式成立，黨政機關駐呼和達布蘇（今雅布賴鹽化公司舊址）；1965年9月，阿右旗將旗府所在地遷至額肯呼都格；1979年11月，額肯呼都格鎮成立，旗府所在地地名由此沿用至今。“巴丹吉林”系蒙 古語， “巴丹”是 由巴岱（人名）演變而來，“吉林”（吉仁音譯）是 數詞，即 六十。幾百年前，有一名叫 巴岱的牧民居住在巴丹吉林沙漠的大沙山旁，歷盡艱辛在這片沙漠中發 現六十個大小不一的海子，后人為 紀念他故稱巴丹吉林沙漠。
巴丹吉林沙漠總面積4.92萬平方公里，其中71%的面積在阿右旗境內。巴丹吉林沙漠是阿右旗最重要的旅游資源，而由于旗府所在地地名與景點名稱不一致，致使獨特的自然資源不能充分發揮品牌宣傳作用，中心城鎮游客量一直處在較低水平，在一定程度上影響了旅游業和相關產業的發展。
額肯呼都格鎮被批復更名為巴丹吉林鎮，將進一步體現地名的地方旅游文化特色，充分發揮巴丹吉林旅游品牌效應，打造巴丹吉林沙漠旅游名鎮，促進地方旅游業品牌化發展，從而實現社會效益、經濟效益、文化效益的共贏。