桂子山石柱林景區是六合國家地質公園的核心景區，位于六合城北約17公里，與金牛湖景區緊鄰，由六合城區經金江公路即可直達，交通便捷。桂子山石柱林被評列為金陵名勝之一，描述為“上溯萬年，沖天赤焰三千丈；遨游六合，擲地瓊林十萬株”。從科學的角度講，桂子山石柱林系千萬年前火山爆發時，玄武巖漿噴射到地面冷卻收縮后形成六棱型、五棱型等不同形態的“柱狀節理”。現有的石柱林直觀陡壁高達50余米，山體巖壁約有5萬余根熔巖石柱，它們或直立、或傾斜，如修飾性開發后直觀高度可達100米，雄偉壯觀，令人稱奇。
該地區原是一采石廠，1983年南京大學地質系教授徐克勤在周邊地區作地質考察時，首次發現是比較規則的石柱林，后建議上級政府給予保護，并作為南京大學等高校的地質考察點。該奇跡被發現后，吸引了國內外地質界的濃厚興趣，1987年被南京市列為金陵四十景之一，1996年8月被第三十屆國際地質大會指定為代表考察地點，有意大利、丹麥等13個國家和地區的地質專家到現場考察，并給予了高度評價。
景區的平面布局可分為三部分。自金江公路桂子山入口到游客廣場為引導區，地質博物館為科普教育區，山體部分為奇跡觀賞區。
引導區有供游客停車、休息的基本設施，建有“六合國家地質公園”的標志性建筑物—門碑，有近5000平方米的園林綠化景觀，鄉土氣息濃烈。
六合國家地質公園博物館，全面展示了地質公園的科學與文化，是青少年科普教育的重要基地。博物館按順序分為6個廳。一是接待和服務廳，為景區工作人員辦公和游客接待的場所。二是多功能影視廳，有多媒體影像，介紹六合及桂子山景區的地質布局和特點，讓游客詳細了解六合全區的地質地貌和風土人情。三是模型廳，按照等比例的設計將六合全區各個地質景觀的全貌，用實物反映給游客，讓游客落腳桂子山就能對其他的景點有所認識。四是火山與石柱林展廳，通過23塊地質資料展板和部分實物，讓游客充分了解到世界各地和中國的火山分布，各地的火山類型及特點，了解石柱林的形成過程及特點，增加游客對火山的感性認識。五是火山爆發演示廳，在圖片介紹火山科學知識的基礎上，制作火山噴發實物模型演示。融合噴發系統、聲光電系統、軟件控制系統、模擬巖漿流演示系統、熱感系統等為一體，演示火山噴發實景，讓游客有親臨火山噴發現場的真實感覺。六是雨花石與文化展廳，展示南京特產六合雨花石和中國現代民間藝術四合農民畫，在實物和作品展覽的基礎上，安排農民作者現場創作，供游客觀賞和收藏。
走出地質博物館，就進入奇跡觀賞區。沿著蜿蜒曲折的游客登山步道，可以登臨桂子山頂，既可俯視近處的農家田園風光，也可遠眺金牛湖和冶山的山湖景色，有心曠神怡之感。從步道下到山腳，石柱參天景觀盡收眼底。熔巖石柱呈五棱或六棱整齊排列，聳立而呈石柱崖，其北側為傾斜石柱。石柱約有5萬余根，寬40-50cm，每段高達10-35cm，巍然壯觀，備受國內外專家學者贊賞。
交通指南景區地址：江蘇省南京市六合區冶山鎮桂子山
乘車線路：從南京乘玉橋—六合、中山南路—六合或中央門—六合公交線路到六合南門，轉乘六合—冶山專線即到
自駕線路：南京市區 — 寧六公路 — 金江公路 — 六合公路 — 石柱林